金湖县人民医院前身为宝应县金沟区卫生所，始建于1950年10月19日，是境内建国后最早的公立卫生机构。初建时，设在金沟镇东范姓家，有房屋8间，其中瓦房5间，草房3间。有医生2人、护理、司药、会计各一人，简易病床4张。

1954年因水灾迁入黎城镇，易名为宝应县金沟区医院。

1958年5月5日更名为宝应县黎城医院，7月10日，又更名为宝应县湖西人民医院，监管宝应湖西卫生行政工作。

随着金湖置县，1960年6月，湖西人民医院正式升格为金湖县人民医院，为全县医疗技术指导中心，时有医务人员21人，设病床30张。

1978年后，金湖县人民医院得到迅速发展，医院规模逐渐扩大，医疗设备逐年更新，医疗技术水平不断提高。

1988开始建设面积为5100平方米的6层综合病房楼，至1990年底，人民医院有职工253人，是建县初的9.6倍。

1995年12月创建成为二级甲等综合医院，经过全院职工的努力和政府的大力支持， 2013年异地新建后医院占地面积98.87亩，建筑面积69590平方米，医院核定床位600张，实际开放床位700余张，职工700多名。

2015年4月获批挂牌淮安市康复医院。

2016年5月经过评审顺利成为江苏护理职业学院附属医院。

2017年10月成为南京医科大学康达学院教学医院。

2019年5月与东南大学附属中大医院集团签约揭牌并进行深度合作。

2019年6月上海名医专家团金湖工作站在我院签约揭牌。

2019年8月于振坤耳鼻咽喉头颈外科中心金湖分中心签约揭牌。

2020年1月成为江苏省基层特色消化科省级孵化中心培训基地。

2020年8月加入江苏省血液病专科联盟理事单位。

2020年8月传染病发热门诊楼项目开工。

2020年8月获2019届艾力彼医院排行县级医院500强。

2020年9月实训楼奠基开工。

2020年9月被江苏省卫健委办公室确认为江苏省2020年第一批防治卒中中心。

2020年11月江苏省妇幼保健协会发布《关于确认母婴友好医院的通知》（苏妇幼协〔2020〕29号），确认为江苏省母婴友好医院。

2020年11月被淮安市人力资源和社会保障局确认为淮安市工伤康复协议医疗机构。

2020年11月金湖县人民医院胸痛中心顺利通过认证，成为国家级胸痛中心。

2020年12月南京医科大学附属眼科医院“蒋沁教授工作室”签约揭牌并合作。

2021年4月被淮安市人民政府授予淮安市五一劳动奖状。

2021年5月南京鼓楼医院疼痛学院金湖县人民医院培训基地签约牌。

2021年6月确认为中国幽门螺杆菌分子医学中心诊疗协作中心。

2021年6月确认为江苏省超声介入消融诊疗中心成员。

2021年7月传染病发热门诊楼正式启用。

2021年7月荣获全国“县域医疗榜样力量”系列评选“管理团队最佳风范奖”。

2022年1月成为扬州大学医学院教学医院。

2022年2月与江苏省人民医院签约揭牌。

2022年3月，成功入选国家卫健委确定首批纳入国家“千县工程”县医院综合能力提升工作的县医院名单。

2022年8月，南京医科大学医学人文研究院实践基地正式落户我院。

2022年8月，荣膺中国县域卫生改善医疗服务示范奖。

2022年9月，成功入选2022年江苏省职业教育校企合作示范组合培育项目名单。

2023年4月，2021年度全国二级公立医院绩效考核—国家监测考核成绩公布，金湖县人民医院在全国排名第173名，在江苏省排名第3名。

2023年4月，被国家卫生健康委授予疼痛综合管理试点医院。

2023年8月，被江苏省卫生健康委确定为江苏省老年友善医疗机构优秀单位。

2023年8月, 被金湖县精神文明建设指导委员会授予“金湖县2020-2022年度文明单位”。

2023年10月，被国家卫生健康委医政司确定为手术治疗安全提升行动联系单位。

2023年11月，6个科室通过市级临床重点专科评审。

2023年12月，通过省级节能示范单位复评审。

面向未来，医院每位职工将牢记 “诚信、仁爱、发展”院训，践行“服务于患者、奉献于社会”宗旨，满怀“关爱生命、维护健康”愿景，齐心协力将医院建设成为苏北地区一流的人文化、现代化、精细化的县级综合性医院，并创建成为省内知名的康复医院。